اصول کارکرد مخزن اسپتیک با استریل کردن آغاز می‌شود. مخزن اسپتیک توسط بخاری با حداقل دمای 125 درجه سانتی‌گراد و به مدت 30 دقیقه استریل می‌گردد. تانک استریل شده پیش از دریافت محصول توسط گردش جریان ملایمی از آب نرم در ژاکت، به تدریج خنک می‌شود. در طول خنک شدن، برای جلوگیری از ایجاد خلاء و از بین رفتن شرایط اسپتیک، جریان هوای استریل پرفشار وارد تانک می‌شود. در زمان تولید، هوای استریل فشار مثبتی را بر روی سطح محصول اعمال می‌کند. این جریان فشاری که به صورت کاملا اتومات کنترل می‌شود، ضمن تامین فشار لازم برای تغذیه پرکن در حال کار، شرایط اسپتیک را نیز حفظ می‌کند. این تانک به همزنی مجهز است که در زمان تولید محصول را به صورت همگن نگه می‌دارد؛ بسیار مهم است که در زمان CIP و جهت حذف هرگونه نقطه آلوده، به گونه‌ای برنامه‌ریزی شود که همزن در محلول سود و اسید غوطه‌ور گردد.